微生信
线上社交如微信、微博也能丰富生活 #生活乐趣# #社交互动#
聚类图,热图
简介
利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类。调用pheatmap R包
数据说明
第一行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名)
注意:1,若基因有重名的,取均值;样品也不能有重名的。2,制表符分隔,可以在excel中做转化(例如log2等,这里默认数据已经处理好),然后贴过来。
变种:若数据仅0,1,那么可以选择前后两种颜色展示(例如黑白),若数据仅三种(例如-1,0,1),则可以选3种颜色展示。
论文例子
Integrated network analysis to explore the key genes regulated by parathyroid hormone receptor 1 in osteosarcoma Fig 1.
常见问题
1,为什么样品顺序变了?
聚类算法会根据数据的相似性对样品(列)和基因(行)进行重新排序,以更好地展示数据的模式和结构,所以顺序会变化。若要保持一致,请选择不聚类
如何引用?
建议直接写网址。助力发表8700+篇(google学术),7400+篇(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on 10 Dec 2024), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.

网址:微生信 https://m.klqsh.com/news/view/324053
相关内容
微信,是一种生活方式微信互动
【微信输入法】微信输入法 1.3.2
微信支付
微信圈子是什么 微信圈子怎么玩
【企业微信下载 电脑版】企业微信 4.1.36
微信圈子是什么?微信圈子入口位置在哪
微信读书
成功励志微信公众号 有哪些励志的微信公众号?
微信生活必备公众号有哪些
随便看看
- 这些女明星未修图照片,比修过图的还惊艳,你不看看吗?
- 9位女星“未修生图“曝光!赵露思这么瘦?赵丽颖萝卜腿消失
- 未修图的六位女星,迪丽热巴差别太大,杨幂自然却不及刘亦菲!
- 女明星未修原档生图流出,杨幂显黑,迪丽热巴显老,杨颖赢麻了
- 秋水共长天一色:图一:赵雅芝的无修图照片图二、图三:刘晓庆的无修图照片图四,李子柒,一下子,这些照片,让我想到,现在是不是,流行,晒素颜,明星也是人,也会老去,也会有皱纹、斑点,这很正常,谁不会老呢,对吧,就像,赵雅芝,曾经的“白娘子”,现在脸上也有了岁月的痕迹她看起来,还是很优雅,岁月从不败美人,这句话,好像,有点道理,美人迟暮,但那是一种,沉淀下来的美,一种,经历过岁月洗礼的美,不是吗,我觉得...

